Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UCHL3P15374 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UCHL3P15374 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms