Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATF2P15336 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATF2P15336 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATF2P15336 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATF2P15336 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF2P15336 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF2P15336 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF2P15336 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF2P15336 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms