Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HRES1P13985 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
HRES1P13985 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HRES1P13985 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HRES1P13985 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms