Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACTN1P12814 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms