Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
COL11A1P12107 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL11A1P12107 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms