Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CHGAP10645 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHGAP10645 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHGAP10645 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHGAP10645 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHGAP10645 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHGAP10645 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHGAP10645 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms