Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HKR1P10072 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HKR1P10072 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HKR1P10072 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HKR1P10072 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HKR1P10072 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HKR1P10072 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms