Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC192P0DO97 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC192P0DO97 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms