Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMIGD3P0DMS9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD3P0DMS9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms