Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RD3LP0DJH9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RD3LP0DJH9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms