Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PNMA6AP0CW24 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PNMA6AP0CW24 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms