Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM228BP0C875 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM228BP0C875 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms