Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C4AP0C0L4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C4AP0C0L4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms