Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP1P09874 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP1P09874 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP1P09874 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP1P09874 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PARP1P09874 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PARP1P09874 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP1P09874 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP1P09874 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP1P09874 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP1P09874 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP1P09874 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP1P09874 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms