Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MMP10P09238 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MMP10P09238 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MMP10P09238 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MMP10P09238 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP10P09238 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP10P09238 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP10P09238 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP10P09238 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP10P09238 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MMP10P09238 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MMP10P09238 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP10P09238 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP10P09238 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP10P09238 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP10P09238 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP10P09238 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP10P09238 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MMP10P09238 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MMP10P09238 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP10P09238 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MMP10P09238 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms