Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GLI1P08151 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GLI1P08151 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GLI1P08151 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GLI1P08151 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms