Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJB1P08034 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJB1P08034 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB1P08034 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB1P08034 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB1P08034 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJB1P08034 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJB1P08034 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJB1P08034 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB1P08034 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB1P08034 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms