Protein–RNA interactions for Protein: P07451

CA3, Carbonic anhydrase 3, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA3P07451 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA3P07451 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CA3P07451 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CA3P07451 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CA3P07451 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CA3P07451 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA3P07451 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CA3P07451 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CA3P07451 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA3P07451 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA3P07451 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CA3P07451 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA3P07451 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA3P07451 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA3P07451 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CA3P07451 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms