Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MYCNP04198 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYCNP04198 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYCNP04198 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYCNP04198 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYCNP04198 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYCNP04198 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYCNP04198 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYCNP04198 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYCNP04198 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYCNP04198 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms