Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PF4P02776 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PF4P02776 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PF4P02776 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PF4P02776 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4P02776 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4P02776 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4P02776 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PF4P02776 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms