Protein–RNA interactions for Protein: P02743

APCS, Serum amyloid P-component, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCSP02743 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APCSP02743 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APCSP02743 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APCSP02743 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
APCSP02743 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms