Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFNB1P01574 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNB1P01574 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNB1P01574 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNB1P01574 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNB1P01574 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNB1P01574 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258 ms