Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRUB2O95900 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms