Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2F6O75461 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
E2F6O75461 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F6O75461 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F6O75461 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F6O75461 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F6O75461 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
E2F6O75461 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
E2F6O75461 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
E2F6O75461 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms