Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF3O75054 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms