Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MARCH6O60337 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MARCH6O60337 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms