Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CEP104O60308 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP104O60308 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP104O60308 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP104O60308 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP104O60308 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP104O60308 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP104O60308 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP104O60308 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP104O60308 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP104O60308 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP104O60308 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP104O60308 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms