Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HTATSF1O43719 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms