Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SART1O43290 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SART1O43290 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SART1O43290 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SART1O43290 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SART1O43290 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SART1O43290 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SART1O43290 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SART1O43290 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SART1O43290 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms