Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

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Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPHP1O15259 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
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NPHP1O15259 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
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NPHP1O15259 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPHP1O15259 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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