Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYNMO15061 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SYNMO15061 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SYNMO15061 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SYNMO15061 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SYNMO15061 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYNMO15061 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SYNMO15061 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYNMO15061 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYNMO15061 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNMO15061 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNMO15061 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNMO15061 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNMO15061 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYNMO15061 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms