Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AGRNO00468 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms