Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PIK3C2AO00443 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms