Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3CDO00329 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CDO00329 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms