Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TULP1O00294 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TULP1O00294 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TULP1O00294 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TULP1O00294 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TULP1O00294 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TULP1O00294 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms