Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DFFAO00273 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DFFAO00273 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DFFAO00273 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DFFAO00273 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DFFAO00273 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DFFAO00273 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DFFAO00273 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DFFAO00273 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms