Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms