Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01387J3KSC0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms