Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMX2-CTNND1H3BSU7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms