Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRRN3E7EW58 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LRRN3E7EW58 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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