Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
B4DXG7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DXG7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DXG7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DXG7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DXG7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DXG7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
B4DXG7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
B4DXG7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
B4DXG7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
B4DXG7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
B4DXG7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
B4DXG7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms