Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SRRM5B3KS81 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SRRM5B3KS81 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms