Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LIPT2A6NK58 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LIPT2A6NK58 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms