Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C5orf60A6NFR6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C5orf60A6NFR6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms