Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA6L9A6NEM1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L9A6NEM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms