Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GOLGA6L4A6NEF3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GOLGA6L4A6NEF3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms