Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VWA3AA6NCI4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms