Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
HMX2A2RU54 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms