Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPDC1A2A3K4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPDC1A2A3K4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms