Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 CLNK-201ENST00000226951 5599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SMAD2-205ENST00000586040 1971 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AL158071.4-201ENST00000608358 4125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC026877.1-201ENST00000476047 1411 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 TBC1D13-201ENST00000223865 3378 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 PDCL-201ENST00000259467 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 ZNF551-201ENST00000282296 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 PAX6-246ENST00000638963 1580 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC015883.1-201ENST00000623054 2074 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 PITRM1-203ENST00000380994 2579 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 TMEM52B-201ENST00000298530 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LCP1P13796 ZFYVE26-209ENST00000557306 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 LINC00461-201ENST00000500197 3381 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 PTPRD-207ENST00000463477 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 ZBTB10-201ENST00000379091 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 EIF2A-203ENST00000460851 2198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 TPD52L3-201ENST00000314556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SMIM8-206ENST00000608353 2111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 ZSCAN25-202ENST00000334715 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 CNTNAP4-201ENST00000307431 4867 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 CCNK-204ENST00000555049 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 CNTNAP4-207ENST00000611870 4867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 C1orf220-202ENST00000521244 2577 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 BTD-206ENST00000437172 2097 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 GPRC5D-201ENST00000228887 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 S100P-201ENST00000296370 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 HSD17B3-202ENST00000375263 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 GPRC5D-202ENST00000396333 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AL139095.2-201ENST00000407940 730 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AL136366.1-201ENST00000416996 964 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC021028.1-201ENST00000417559 598 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AL021707.4-201ENST00000423346 410 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 FTLP2-201ENST00000431458 528 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC022400.1-201ENST00000434147 445 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AL162584.1-201ENST00000437097 633 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 LINC01803-201ENST00000438659 613 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC083939.1-201ENST00000445475 126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RN7SL151P-201ENST00000460537 283 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RN7SL865P-201ENST00000466711 289 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC009078.1-201ENST00000474978 783 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 TRAF3IP3-212ENST00000477431 791 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RPL7AP9-201ENST00000484287 800 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SSR2-213ENST00000496742 825 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC006978.1-201ENST00000496846 1234 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 LINC02115-201ENST00000503367 432 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC025524.2-201ENST00000520862 536 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC044839.2-201ENST00000531982 534 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 NINJ2-205ENST00000542920 670 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 GLYCAM1-204ENST00000550226 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 BOLA2P2-202ENST00000604904 567 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC083798.2-203ENST00000608346 564 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RMND1-201ENST00000336451 1413 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SLAMF7-202ENST00000368042 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 HMGCLL1-205ENST00000398661 2532 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SLU7-201ENST00000297151 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 NUTM1-201ENST00000333756 3795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 PIEZO2-201ENST00000302079 9356 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AL035696.1-201ENST00000381078 2007 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 ZNF557-202ENST00000414706 5736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 LIN52-205ENST00000555028 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 CYFIP2-209ENST00000521420 6370 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 CPT1B-201ENST00000312108 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LCP1P13796 MYO7B-201ENST00000409090 3567 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 HIVEP3-201ENST00000372583 12193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 ADAM9-209ENST00000487273 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 COL12A1-201ENST00000322507 11723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 POLR2J3-215ENST00000511313 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 CCDC136-201ENST00000297788 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 HIST1H2BC-201ENST00000314332 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RN7SKP246-201ENST00000364553 317 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RN7SKP7-201ENST00000410540 285 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AL133325.2-201ENST00000431034 449 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 LINC01280-201ENST00000449783 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC084398.1-201ENST00000494902 459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC008897.2-201ENST00000501886 527 ntTSL 4 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC233724.11-201ENST00000508480 404 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 RNU2-24P-201ENST00000516830 143 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC136443.3-201ENST00000546674 676 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC124248.1-201ENST00000558221 402 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
LCP1P13796 AC092718.2-201ENST00000562315 487 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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